游离的氨基和羧基是指没有成键的氨基和羧基，游离氨基就是-NH2，游离羧基就是-COOH，蛋白质主链上，只有末端有一个游离的氨基和一个游离的羧基。

氨基（Amino）由一个氮原子和两个氢原子构成，化学式为-NH2。在有机化学中，氨基是基本碱基，大多数含有氨基的有机物都有一定碱的特性，在氨基酸合成多肽时，氨基能与羧基发生脱水缩合。