朱标这一支没有后代，朱标早逝，洪武三十一年，皇太孙朱允炆继位，是为建文帝。建文帝与亲信大臣齐泰、黄子澄等采取一系列削藩措施。与此同时，也在北平周围及城内部署兵力，又以防边为名，把明太祖第四子燕王朱棣的护卫精兵调出塞外戍守，准备削除燕王。

不久，朱棣于建文元年起兵反抗，随后，他挥师南下，史称“靖难之役”。靖难之役爆发后，朱棣成功夺取了皇帝宝座，朱棣和他父亲很像，属于绝不留情的那一类人。朱标做太子的时候，先后有过两个太子妃，一位是常玉春的女儿，可惜在生朱允熥时，难产去世。而她生的皇长子朱雄英，也在洪武十五年时，生病而亡。

朱标的第二个太子妃，是太常寺卿吕本的女儿，一共育有三子，分别是朱允炆，朱云熞和朱允熙。当年，朱棣将吕氏请到了自己的军营中，向她阐述一番，自己为什么要起兵的原因。这不过是朱棣自圆其说罢了，做给全天下人看，同时，也给自己顺理成章做皇帝找了一个台阶。